段秀带领二百名士兵，赶着一辆木笼囚车来到姑孰。王敦被埋在议事厅不过才一个月，虽然没有起坟头，但院子里的新土清晰可见。段秀一声令下，士兵们轮流开挖。不到一个时辰，草席裹着的王敦尸体，就出现在段秀和士兵们面前。士兵们用铁锹敲打着草席上的蜡，让蜡脱落下来，然后把捆草席的绳子解开。
“把反贼王敦双手反绑起来，尸身跪着装上木笼囚车，拉回建康！”段秀大声说道。士兵们按着段秀的命令，把王敦的双手先反绑起来，然后把尸身架到木笼里。木笼里的死人，当然要受活人的摆布。两个士兵把尸身摆成下跪的姿势，另外两个士兵用一根绳子，把王敦的脑袋系到木笼上的横木上。然后又用四条绳子拴住王敦的尸身，再拴到木笼上，防止王敦尸身倾斜。
一个士兵赶着木笼囚车，段秀骑在马上，和其他士兵返回建康。一路上见到囚车的百姓，都感到很好奇，纷纷指指点点。有些好事的人凑近一看，原来是个死人，大叫一声，都跑开了。
段秀率领着二百士兵，木笼囚车在前面，来到了建康南面的御道上。司马绍和文武大臣，已经在南篱门外等候着。
来到司马绍跟前，段秀跪下说道：“陛下，乱臣贼子王敦，利令智昏，祸乱朝纲；为所欲为，大逆不道。身败名裂，死有余辜。臣率领手下士卒，把王敦尸身拉回了建康，请陛下定夺！”
文武大臣前面，站着二十个士兵。其中两个士兵，分别端着一个木匣。木匣里面，是钱凤和沈充的首级。外围还有很多士兵和侍卫，把司马绍和文武大臣围在里面。前来看热闹的建康百姓，还有过路的人，把现场围了水泄不通。司马绍站起来说道：“各位爱卿，建康和江南的百姓们。王敦之乱，前后历时两年。这是先帝在江南立国以来，江南经历过的最大劫难。王敦之恶，祸国殃民；王敦之罪，罄竹难书。家有家规，国有国法。王敦这个罪大恶极的反叛始作俑者，即便是死了，也必须接受国法的惩罚！”
司马绍说完，朝段秀点点头。段秀一挥手，几个士兵上到囚车上，把王敦的尸身解开，架了下来。段秀大声说道：“解开逆贼王敦身上的绳子，把他的外衣扒下来烧掉！”
王敦身上的外衣被扒掉，衣服被付之一炬。司马绍和文武大臣看着面前的熊熊大火，若有所思。段秀继续说道：“把反贼王敦的双手反绑起来，让他跪在陛下和文武百官面前！”
“砍下反贼王敦的脑袋！”段秀接着说道。一个手拿战刀的士兵来到王敦尸身跟前，干净利索地砍下了王敦的脑袋。
“这就是乱臣贼子的下场！把王敦、钱凤、沈充三个人的首级，挂到南篱门的南桁上去，让江南百姓都看看反贼的下场！”段秀刚说完，在外围看热闹的百姓们，冲破士兵们的包围圈来到王敦尸身跟前。有的用手里的鹅卵石，有的用小石子，有的用鸡蛋、苹果、梨等，雨点儿般砸向王敦的无头尸和首级。
“乱臣贼子，遗臭万年！”很多百姓一边投掷手里的东西，一边骂着。士兵和侍卫们，把这些百姓又劝到了外围。几十个士兵一齐动手，把王敦、钱凤、沈充的首级，挂到了南篱门南桁上。
王敦的首级挂在中间，钱凤的首级在东，沈充的首级在西。文武大臣们在忐忑不安中，看着南桁上三个人的首级。郗鉴出班说道：“陛下，前朝诛戮杨骏等反叛之人，都是先施行官方的刑罚，然后允许私人殡葬。我认为诛戮叛臣表现公理国法，私人情义则体现私交，应该听任王敦的家属收葬，在道义上更为弘大。”
司马绍听了，点点头说道：“郗爱卿所言甚是，朕准奏。”
自司马绍平定了王敦之乱，建康和江南各地呈现出了安定祥和的景象。虽然已经进入了冬天，但十月的江南仍然温暖如春。
太极殿前殿，司马绍神情自若，准备封赠平叛有功的文武大臣。拿着沉甸甸的封赠诏书，想着郁闷去世的父皇，司马绍思绪万千。下面的文武大臣，也难以抑制激动的心情。
“费仁，宣读封赠平叛有功大臣的名单和职位！”司马绍说道。费仁来到司马绍面前，接过诏书，回到台阶边开始宣读：
诏曰
王敦之乱，彻底平息。文臣武将，论功行赏。任司徒王导为太保，兼领司徒之职。封为始兴郡公，食邑三千户，赐绢九千匹，以特殊礼仪相待；尚书令郗鉴，封为高平县侯，食邑一千六百户，绢四千八百匹；令西阳王司马羕兼领太尉之职；护军将军应詹封为观阳县侯，食邑一千六百户，绢四千八百匹。改任使持节、都督江州诸军事、平南将军、江州刺史；刘遐封为泉陵县公，升任北中郎将、徐州刺史，代替王邃镇守淮阴；任命苏峻为使持节、冠军将军、历阳内史，加散骑常侍，封邵陵县公，食邑一千八百户，绢五千四百匹；授予中书监庾亮护军将军之职，封为永昌县公，食邑一千八百户，绢五千四百匹；任命丹阳尹温峤为前将军，封为建宁县公，食邑一千八百户，绢五千四百匹；豫州刺史祖约进号为镇西将军，受命屯驻寿阳。尚书卞壸封为建兴县公，食邑一千八百户，绢五千四百匹；右将军卞敦封为益阳县侯，食邑一千六百户，绢三千二百匹。其余将士，封赏各有差等。
太宁二年十月
郗鉴、司马羕、应詹、刘遐、苏峻、庾亮、温峤、卞壸、卞敦、祖约出班跪下，一齐说道：“臣谢主隆恩！万岁！万万岁！”
王导出班跪下说道：“陛下，臣受任司徒之职，能为陛下和朝廷效力就行了。太保，臣实在不能领受，请陛下收回成命！”