难得走到小河边，小智等人决定在小河边钓鱼休息一下，瑟雷娜则是为火焰狐梳毛。谁料想偷偷藏在小河里的杰尼龟向小智一行人使用水枪，火焰狐也被喷了一身。措手不及的小智等人被杰尼龟军团用绳子绑在了一起，丝毫没有还手之力。突然火箭队的喵喵走了出来，原来是喵喵指使杰尼龟军团干的。得意洋洋的杰尼龟军团带着被绑住的小智等人来到一个并不深的洞窟。
“不好了，瑟雷娜，火焰狐好像要发高烧了，一只在抖个不停，可能是刚才的水枪的缘故。”细致的小刚发现火焰狐的不对劲，提醒瑟雷娜。瑟雷娜开始不安，在她心里除去小智以外，最看重的就是火焰狐，但是不巧的的是在这一路上药早就用完了，刚才为了娱乐忘记准备药了。不安的瑟雷娜开始求着杰尼龟“求求你们了，放我走吧，不然火焰狐随时会死掉的。”听到这些杰尼龟军团开始动容，虽然它们讨厌人类，但是并不代表希望小精灵也会出事，打算放瑟雷娜离开。
一向爱做坏事的喵喵看见小次郎他们还没有准备好东西过来，知道一旦放几个小鬼离开恐怕就没有机会了，在一旁想出了一个坏主意“不能放他们离开，否则谁知道他们会不会逃走。要知道人类是不可信的。”本性善良的杰尼龟并没有把瑟雷娜逼到死角，半开玩笑半认真的表示，瑟雷娜可以离开到镇上买药，不过时间限于第二天中午之前回来，否则处死小智他们。小霞大叫不公平，让她去，小智最关键的时候发话了“好了，小霞，我相信瑟雷娜会回来的。”
在路上，瑟雷娜并没有那么顺利，跑了一段路的瑟雷娜没有看清路，被小石子绊了一脚，顺势跌倒在地。走到一个悬崖边，一座吊桥年久失修，看着很难支持一个人的重量，但是管不了那么多的瑟雷娜还就果断的决定从这儿过，沿着绳索有惊无险的mo索了过去。最后终于到达了目的地，瑟雷娜几乎感觉到了虚脱，可是想到生病中的火焰狐和还处在危险中的小智，不得已打起精神买好药准备回去。瑟雷娜没有想到几乎是在同一时间，火箭队在另一个地点用假的火箭筒打劫到许多炸弹。准备抢小智的皮卡丘和杰尼龟军团。
幸运的是回头的路上遇到了君莎小姐，瑟雷娜解释了事情的缘由，正义的君莎小姐骑着摩托开向目的地。终于走到了断桥处君莎小姐发现了断桥无法通过，只能另行寻找其他的路径，火箭队这一次因为君莎小姐的绕路侥幸的比君莎快了一步。
火箭队拿出炸弹扔向小智等人“呵呵，这下借助炸弹可以很容易的把你们打败这回我看你们往哪逃。没有任何顾忌的火箭队甚至把炸弹扔到了森林中。及时赶到的君莎小姐和瑟雷娜看见到了这一幕。杰尼龟军团的老大有想要保护自己的兄弟，没有及时的逃到洞窟里，把药水交给小刚让小刚给火焰狐上药。自己则是跑到吉尼龟的身边就它。瑟雷娜不知道这一幕打动了整个杰尼龟军团。到了相对于安全的地方，瑟雷娜命令对使用热气球漂浮在半空中的火箭队攻击。没想到这一招打中了热气球，倒霉的火箭队被化为了流星。
但是祸根并没有完全解决，森林由于火箭队到处扔炸弹的关系，起了熊熊大火，君莎小姐不知道该做如何处理。“君莎小姐，这样，让杰尼龟军团使用水枪的话可以灭掉火灾。”瑟雷娜焦急的建议道。杰尼龟军团听到瑟雷娜的建议，全部出动使用水枪。小智也派出了自己的杰尼龟，小霞则是同样派出了自己的海星星和宝石海星。
在杰尼龟军团的帮助下，终于扑灭了森林的火灾。由于瑟雷娜拼命救杰尼龟老大感动了整个杰尼龟军团，决定改邪归正。君莎小姐最后对杰尼龟军团颁发了奖状和任命状。“由于杰尼龟军团的努力使小镇脱离了危险，所以感谢杰尼龟军团的帮助。同时任命为杰尼龟军团为该地区的杰尼龟水枪队。”
杰尼龟事件结束了，小智一行人决定离开去往枯叶市道馆。这时候皮卡丘拽了拽小智的裤脚，表示有人跟了上来。几人转过头看着，原始是杰尼龟军团的老大。小智问道“杰尼龟，你是想要和我们一起旅行么？”杰尼龟点了点头，随后跑到瑟雷娜的身旁，表示愿意跟随瑟雷娜。就这样吉尼龟被瑟雷娜收服了。
瑟雷娜成功收服了杰尼龟，可是倒霉的小智一行人终于还是迷路了。本以为走出森林就万事大吉，没想到误打误撞的走到不知名的海边。一直兴致冲冲的小智在即收服不了小精灵，也没办法挑战道馆的情况下变得没精打采。
灰头丧气的小智不知道踩到什么跌了一跤，爬起来一看原来是以海边为栖息地的大钳蟹，不好意思的小智本想蹲下身体向大钳蟹道歉，不知趣的大钳蟹用钳子夹住了小智的手指，小智吃了一亏，怒骂道“想打架是不是？来吧，看我怎么打败你！皮卡丘，对准他使用十万伏特！”皮卡丘听到命令立马使出一记十万伏特，没有丝毫准备的大钳蟹，没有躲过去。由于电系克制水系的缘故，立马晕了过去。小智扔出宝贝球收服了大钳蟹。
郁闷了一整天的小智走了一天还是没有找到可以住宿的地方，放出大钳蟹准备撒气，谁让他白天欺负自己来着？“皮卡、皮卡！”不知道看到了什么，皮卡丘一阵欢呼，小智一行人顺着皮卡丘的目光，看见了一座灯塔在暗黑的天空下闪烁着。小霞立马兴奋起来，整个白天抱怨的人不只是小智，还有小霞，每天都睡在地上很不自在，这下终于可以睡在软绵绵的大床上了，迫不及待的冲向灯塔。
到了灯塔的门口，小智礼貌的摁响了门铃，奇怪的门铃声让几个人毛骨悚然，由于好不容易找到一个可以住宿的地方还是选择等待主人的回答。“谁啊？”青年的声音传出，几个人联想到可能不是怪物，便不再害怕了。
“可以借助你们的电话用一下么？”小智仍旧是礼貌的问起问题。小霞责怪他问问题不在重点上，把小智推到在一边，自己大声的问起问题“请问可以在你们这儿借宿一晚么？我们在外面夜宿好几天了。”小刚为了增加可以借宿的可能性，拿出了自己的招牌“如果可以借宿的话，我想我可以做一些好吃的饭菜给你，我比较在会做饭。”